En la patología isquémica es fundamental instaurar lo más precozmente posible el tratamiento trombolítico a fin de mejorar el pronóstico y evolución del paciente, pero una de las condiciones necesarias para que se pueda aplicar este tratamiento es que se haya conseguido la exclusión de hemorragia cerebral por neuroimagen. La TC es el método más eficaz, rápido y de bajo costo para el estudio de un evento isquémico agudo, debido a que está inmediatamente disponible a toda hora en la mayoría de los hospitales principales y a que produce imágenes con rapidez; pero también a que tiene beneficios diagnósticos únicos, pues descarta rápidamente una hemorragia cerebral o la presencia de signos radiológicos tempranos que sugieran evento isquémico extenso en evolución, que contraindiquen la trombolisis. Luego la finalidad del TC de urgencias es descartar hemorragia y poner fibrinólisis.

Por otro lado, la RM requiere mucha mayor colaboración del paciente que el TC, ya que la adquisición de las imágenes requiere mayor tiempo, y esto no siempre es posible en pacientes con ACV agudo, quienes suelen estar confusos y no cooperan. Además los pacientes con ACV agudo requieren una monitorización con equipos que son incompatibles con la RMN.